1、使用前的檢查
（1）接通超凈工作臺電源；
（2）旋開風機開關，使風機開始正常運轉，這時應檢查高效過濾器出風面是否有風送出；
（3）檢查照明及紫外設備能否正常運行，如不能正常運行則通知工程部檢修；
（4）工作前必須對工作臺周圍環境及空氣進行超凈處理，認真進行清潔工作，并采用紫外線滅菌法進行滅菌處理；
（5）凈化工作區內嚴禁存放不必要的物品，以保持潔凈氣流流動不受干擾。
2、使用
（1）使用工作臺時，先經過清潔液浸泡的紗布擦拭臺面，然后用消毒劑擦拭消毒；
（2）接通電源，提前50分鐘打開紫外燈照射消毒，處理凈化工作區內工作臺表面積累的微生物，30分鐘后，關閉紫外燈，開啟送風機；
（3）工作臺面上，不要存放不必要的物品，以保持工作區內的潔凈氣流不受干擾；
（4）操作結束后，清理工作臺面，收集各廢棄物，關閉風機及照明開關，用清潔劑及消毒劑擦拭消毒；
（5）最后開啟工作臺紫外燈，照射消毒30分鐘后，關閉紫外燈，切斷電源；
（6）每二月用風速計測量一次工作區平均風速，如發現不符合技術標準，應調節調壓器手柄，改變風機輸入電壓，使工作臺處于最佳狀況；
（7）每月進行一次維護檢查，并填寫維護記錄。
3、清潔
（1）每次使用完畢，立即清潔儀器，懸掛標識，并填寫儀器使用記錄；
（2）取樣結束后，先用毛刷刷去潔凈工作區的雜物和浮塵；
（3）用細軟布擦拭工作臺表面污跡、污垢目測無清潔劑殘留，用清潔布擦干；
（4）要經常用紗布沾上酒精將紫外線殺菌燈表面擦干凈，保持表面清潔，否則會影響殺菌能力；
（5）效果評價:設備內外表面應該光亮整潔，沒有污跡。